Перед проведенням збору матеріалу, яким виступає ранкова порція сечі, необхідно здійснити гігієну зовнішніх статевих органів. Незадовго до проведення процедури, як у чоловіків, так і у жінок, не рекомендується приймати сечогінні препарати, а також вживати їжу, що містить барвники, здатні вплинути на колір сечі. Слід заздалегідь підготувати три стерильні ємності з кришками, і почати процес сечовипускання — у перший контейнер збирається приблизно одна п’ята від загального обсягу, у другий — три п’ятих, і в останній одна п’ята частина. Для діагностики простатиту перед збором третьої порції чоловікам проводиться спеціальний масаж простати, що дозволяє отримати секрет передміхурової залози. По завершенню процедури всі ємкості нумеруються.
Ефективний спосіб встановлення локалізації запального процесу. За допомогою трьохстаканної проби сечі визначається, де конкретно розвинувся запальний процес сечовивідної системи. Проводиться аналіз шляхом поділу сечі, зібраної під час ранкового сечовипускання, на три порції, кожна з яких відповідає за певний відділ локалізації запалення. Наявність еритроцитів і лейкоцитів тільки у першій порції сечі вказує на джерело, що знаходиться в сечівнику (уретрит, пошкодження урерти, пухлина). При локалізації процесу в сечоводі, нирці або ж у сечовому міхурі патологічні домішки виявляються приблизно в однаковій кількості в усіх порціях, якщо вони надходять з вогнища ураження постійно (наприклад, при кровотечі пухлини сечового міхура). Показання для призначення аналізу • при підозрі на наявність хронічного простатиту, уретриту; • для визначення джерела гематурії або піурії, при підвищеній концентрації лейкоцитів, виявленій у загальному аналізі сечі.